半年前に彗星の衝突を宣言されて世の中。世界が滅ぶ残り1週間は混乱と暴徒の後、僅かなライフラインだけが動いていた。そんな中、全寮制のミッション系の学園に通う「白羽小鳩」は誰もいなくなった学園内の教会で神父様を待ちながら管理を行なっていた。そしてもう1人、同級生で問題児になっている「蛇原冬司」と共に。過去に彼の監督も任されていたのだが事件を機に距離を置いていた。ところが、今になって再び以前のような関係を望んでくる。愛する神父を待とうと誓っていたのだが、教会で ”あるもの” を見つけてしまって…。